巧囊（卵巢巧克力囊肿）不孕患者，经不孕检查及初步治疗，如仍无法成功受孕生子，最后将寻求试管婴儿治疗，此时是否需要在试管治疗前先手术处理巧囊？手术除开刀麻醉的风险外，最大的风险是可能造成卵巢损伤，另外，也无证据支持巧囊手术对试管婴儿治疗有帮助。
然而，不手术除了无法确定良性或恶性之外，也可能造成取卵时巧囊感染，此外取卵也会较困难。
原则上，已决定试管婴儿治疗，卵巢上的巧囊可尽量不手术，取卵时也尽量绕过巧囊不碰触。
另外，巧囊患者取卵前，阴道的消毒准备要更彻底，避免取卵后引发骨盆腔感染。
巧囊不孕妇女到院就诊，一般要做如下检查及治疗:1.检查卵巢功能，功能下降者，应尽早接受试管婴儿治疗；2.检查是否合并有其他不孕原因，如输卵管阻塞或男性少弱精，如有多重不孕原因，应考虑直接接受试管婴儿治疗；3.已决定试管婴儿治疗，原则上不手术，除非怀疑是恶性或B超下可见输卵管水肿；4.除巧囊问题外，如卵巢功能及其他检查都很正常，可考虑手术，手术时也要非常小心对卵巢功能的保护，尤其是双侧卵巢都有巧囊者；5.手术后，半年内是受孕黄金时期，如半年至一年半仍无法顺利自然受孕，应寻求试管婴儿治疗，不宜拖太久，以免卵巢功能进一步下降，或巧囊复发。
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